Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

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Length 486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ripk3Q9QZL0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ripk3Q9QZL0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ripk3Q9QZL0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ripk3Q9QZL0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ripk3Q9QZL0 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Ripk3Q9QZL0 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Ripk3Q9QZL0 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Ripk3Q9QZL0 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Ripk3Q9QZL0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Ripk3Q9QZL0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Ripk3Q9QZL0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ripk3Q9QZL0 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms