Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Snai3Q9QY31 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
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Snai3Q9QY31 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Snai3Q9QY31 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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