Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Pkp3Q9QY23 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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Pkp3Q9QY23 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Pkp3Q9QY23 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Pkp3Q9QY23 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Pkp3Q9QY23 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Pkp3Q9QY23 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Pkp3Q9QY23 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Pkp3Q9QY23 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Pkp3Q9QY23 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Pkp3Q9QY23 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Pkp3Q9QY23 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Pkp3Q9QY23 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Pkp3Q9QY23 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Pkp3Q9QY23 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pkp3Q9QY23 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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