Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Foxe3Q9QY14 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Foxe3Q9QY14 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms