Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Opn4Q9QXZ9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms