Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PolkQ9QUG2 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PolkQ9QUG2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PolkQ9QUG2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PolkQ9QUG2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PolkQ9QUG2 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PolkQ9QUG2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PolkQ9QUG2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PolkQ9QUG2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PolkQ9QUG2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PolkQ9QUG2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PolkQ9QUG2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PolkQ9QUG2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PolkQ9QUG2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PolkQ9QUG2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PolkQ9QUG2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PolkQ9QUG2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PolkQ9QUG2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PolkQ9QUG2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolkQ9QUG2 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms