Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Trappc2lQ9JME7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms