Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM96

Cdc42ep4, Cdc42 effector protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep4Q9JM96 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdc42ep4Q9JM96 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cdc42ep4Q9JM96 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms