Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Higd1aQ9JLR9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms