Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL61

Rfx5, DNA-binding protein Rfx5, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx5Q9JL61 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rfx5Q9JL61 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rfx5Q9JL61 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms