Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ldb3Q9JKS4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb3Q9JKS4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb3Q9JKS4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb3Q9JKS4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb3Q9JKS4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb3Q9JKS4 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb3Q9JKS4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb3Q9JKS4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb3Q9JKS4 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb3Q9JKS4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb3Q9JKS4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb3Q9JKS4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb3Q9JKS4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb3Q9JKS4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb3Q9JKS4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb3Q9JKS4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb3Q9JKS4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb3Q9JKS4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb3Q9JKS4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb3Q9JKS4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb3Q9JKS4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb3Q9JKS4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb3Q9JKS4 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb3Q9JKS4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb3Q9JKS4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb3Q9JKS4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb3Q9JKS4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb3Q9JKS4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb3Q9JKS4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb3Q9JKS4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb3Q9JKS4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb3Q9JKS4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ldb3Q9JKS4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb3Q9JKS4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb3Q9JKS4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb3Q9JKS4 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb3Q9JKS4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb3Q9JKS4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb3Q9JKS4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb3Q9JKS4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb3Q9JKS4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb3Q9JKS4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb3Q9JKS4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ldb3Q9JKS4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms