Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl39Q9JKF7 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Mrpl39Q9JKF7 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms