Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Msgn1Q9JK54 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Msgn1Q9JK54 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms