Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gfra4Q9JJT2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms