Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efcc1Q9JJF6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Efcc1Q9JJF6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efcc1Q9JJF6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efcc1Q9JJF6 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efcc1Q9JJF6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Efcc1Q9JJF6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efcc1Q9JJF6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efcc1Q9JJF6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efcc1Q9JJF6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efcc1Q9JJF6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efcc1Q9JJF6 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efcc1Q9JJF6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efcc1Q9JJF6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efcc1Q9JJF6 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efcc1Q9JJF6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Efcc1Q9JJF6 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efcc1Q9JJF6 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Efcc1Q9JJF6 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Efcc1Q9JJF6 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efcc1Q9JJF6 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efcc1Q9JJF6 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efcc1Q9JJF6 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efcc1Q9JJF6 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efcc1Q9JJF6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efcc1Q9JJF6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efcc1Q9JJF6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efcc1Q9JJF6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efcc1Q9JJF6 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Efcc1Q9JJF6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Efcc1Q9JJF6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Efcc1Q9JJF6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms