Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Ccdc86Q9JJ89 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Ccdc86Q9JJ89 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Ccdc86Q9JJ89 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccdc86Q9JJ89 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccdc86Q9JJ89 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc86Q9JJ89 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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