Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

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Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Smad9Q9JIW5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Smad9Q9JIW5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Smad9Q9JIW5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smad9Q9JIW5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smad9Q9JIW5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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