Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gtf2ird1Q9JI57 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gtf2ird1Q9JI57 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms