Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tm9sf3Q9ET30 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms