Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rb1cc1Q9ESK9 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
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