Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
OtofQ9ESF1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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