Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp29Q9ES63 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms