Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim54Q9ERP3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms