Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Dap3Q9ER88 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms