Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Capn12Q9ER56 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms