Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Csnk1dQ9DC28 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Csnk1dQ9DC28 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms