Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc97Q9DBT3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccdc97Q9DBT3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccdc97Q9DBT3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccdc97Q9DBT3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccdc97Q9DBT3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccdc97Q9DBT3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccdc97Q9DBT3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccdc97Q9DBT3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccdc97Q9DBT3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ccdc97Q9DBT3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc97Q9DBT3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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