Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Med27Q9DB40 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms