Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rsph3bQ9DA80 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rsph3bQ9DA80 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms