Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cnot8Q9D8X5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms