Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Snx5Q9D8U8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Snx5Q9D8U8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Snx5Q9D8U8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Snx5Q9D8U8 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
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Snx5Q9D8U8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Snx5Q9D8U8 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Snx5Q9D8U8 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Snx5Q9D8U8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Snx5Q9D8U8 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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