Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T0

Fam3a, Protein FAM3A, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3aQ9D8T0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam3aQ9D8T0 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam3aQ9D8T0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms