Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifi35Q9D8C4 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms