Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Chmp5Q9D7S9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms