Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn23Q9D7D7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn23Q9D7D7 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn23Q9D7D7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn23Q9D7D7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn23Q9D7D7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn23Q9D7D7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn23Q9D7D7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Cldn23Q9D7D7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn23Q9D7D7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn23Q9D7D7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn23Q9D7D7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn23Q9D7D7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Cldn23Q9D7D7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cldn23Q9D7D7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Cldn23Q9D7D7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn23Q9D7D7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn23Q9D7D7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn23Q9D7D7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn23Q9D7D7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn23Q9D7D7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn23Q9D7D7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Cldn23Q9D7D7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn23Q9D7D7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn23Q9D7D7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn23Q9D7D7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn23Q9D7D7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Cldn23Q9D7D7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn23Q9D7D7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Cldn23Q9D7D7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn23Q9D7D7 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn23Q9D7D7 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn23Q9D7D7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn23Q9D7D7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cldn23Q9D7D7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Cldn23Q9D7D7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Cldn23Q9D7D7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Cldn23Q9D7D7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn23Q9D7D7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn23Q9D7D7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Cldn23Q9D7D7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Cldn23Q9D7D7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Cldn23Q9D7D7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn23Q9D7D7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Cldn23Q9D7D7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn23Q9D7D7 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn23Q9D7D7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn23Q9D7D7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn23Q9D7D7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn23Q9D7D7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn23Q9D7D7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn23Q9D7D7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn23Q9D7D7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Cldn23Q9D7D7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn23Q9D7D7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn23Q9D7D7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cldn23Q9D7D7 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn23Q9D7D7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cldn23Q9D7D7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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