Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D1

Rnf225, RING finger protein 225, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf225Q9D7D1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Aoah-202ENSMUST00000221982 919 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 4930447F04Rik-201ENSMUST00000033525 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Gm5656-201ENSMUST00000171020 1096 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 9430037O13Rik-201ENSMUST00000192556 1008 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 AC154843.1-201ENSMUST00000226897 1138 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rnf225Q9D7D1 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf225Q9D7D1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf225Q9D7D1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf225Q9D7D1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf225Q9D7D1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf225Q9D7D1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf225Q9D7D1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf225Q9D7D1 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf225Q9D7D1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf225Q9D7D1 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf225Q9D7D1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf225Q9D7D1 Gm42723-202ENSMUST00000200561 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf225Q9D7D1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf225Q9D7D1 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf225Q9D7D1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf225Q9D7D1 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf225Q9D7D1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf225Q9D7D1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf225Q9D7D1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf225Q9D7D1 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf225Q9D7D1 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf225Q9D7D1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf225Q9D7D1 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf225Q9D7D1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf225Q9D7D1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf225Q9D7D1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf225Q9D7D1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf225Q9D7D1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf225Q9D7D1 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf225Q9D7D1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rnf225Q9D7D1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms