Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klhl40Q9D783 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms