Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MsraQ9D6Y7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms