Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc83Q9D4V3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms