Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pabpc6Q9D4E6 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms