Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Syce1Q9D495 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Syce1Q9D495 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms