Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Ptchd4-201ENSMUST00000048691 6890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Pkd1l2-202ENSMUST00000109093 7389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Rnf165-201ENSMUST00000026494 7300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Muc5ac-201ENSMUST00000041924 8256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Trpm1-201ENSMUST00000085222 5711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Stard13-201ENSMUST00000062015 5526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
4933428G20RikQ9D3X4 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms