Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pus10Q9D3U0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pus10Q9D3U0 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pus10Q9D3U0 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pus10Q9D3U0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pus10Q9D3U0 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pus10Q9D3U0 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pus10Q9D3U0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pus10Q9D3U0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pus10Q9D3U0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pus10Q9D3U0 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pus10Q9D3U0 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pus10Q9D3U0 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pus10Q9D3U0 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pus10Q9D3U0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pus10Q9D3U0 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pus10Q9D3U0 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pus10Q9D3U0 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pus10Q9D3U0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pus10Q9D3U0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pus10Q9D3U0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pus10Q9D3U0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pus10Q9D3U0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pus10Q9D3U0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pus10Q9D3U0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Pus10Q9D3U0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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Pus10Q9D3U0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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Pus10Q9D3U0 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
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Pus10Q9D3U0 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Pus10Q9D3U0 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pus10Q9D3U0 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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