Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Snapc3Q9D2C9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Snapc3Q9D2C9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Snapc3Q9D2C9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Snapc3Q9D2C9 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Snapc3Q9D2C9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Snapc3Q9D2C9 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Snapc3Q9D2C9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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Snapc3Q9D2C9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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Snapc3Q9D2C9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Snapc3Q9D2C9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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