Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chordc1Q9D1P4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms