Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Zbed3Q9D0L1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Zbed3Q9D0L1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Zbed3Q9D0L1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zbed3Q9D0L1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Zbed3Q9D0L1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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