Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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Stx17Q9D0I4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx17Q9D0I4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx17Q9D0I4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx17Q9D0I4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx17Q9D0I4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx17Q9D0I4 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx17Q9D0I4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx17Q9D0I4 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx17Q9D0I4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx17Q9D0I4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Stx17Q9D0I4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
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Stx17Q9D0I4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Stx17Q9D0I4 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx17Q9D0I4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx17Q9D0I4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx17Q9D0I4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx17Q9D0I4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx17Q9D0I4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Stx17Q9D0I4 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx17Q9D0I4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx17Q9D0I4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Stx17Q9D0I4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx17Q9D0I4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx17Q9D0I4 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx17Q9D0I4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Stx17Q9D0I4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx17Q9D0I4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx17Q9D0I4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx17Q9D0I4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Stx17Q9D0I4 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx17Q9D0I4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx17Q9D0I4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx17Q9D0I4 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx17Q9D0I4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Stx17Q9D0I4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Stx17Q9D0I4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Stx17Q9D0I4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx17Q9D0I4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx17Q9D0I4 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx17Q9D0I4 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Stx17Q9D0I4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx17Q9D0I4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Stx17Q9D0I4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx17Q9D0I4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx17Q9D0I4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Stx17Q9D0I4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Stx17Q9D0I4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Stx17Q9D0I4 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Stx17Q9D0I4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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