Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Utp23Q9CX11 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms