Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ8

4930519P11Rik, RIKEN cDNA 4930519P11 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519P11RikQ9CUJ8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
4930519P11RikQ9CUJ8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930519P11RikQ9CUJ8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930519P11RikQ9CUJ8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930519P11RikQ9CUJ8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930519P11RikQ9CUJ8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930519P11RikQ9CUJ8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930519P11RikQ9CUJ8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930519P11RikQ9CUJ8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930519P11RikQ9CUJ8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930519P11RikQ9CUJ8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930519P11RikQ9CUJ8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930519P11RikQ9CUJ8 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930519P11RikQ9CUJ8 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930519P11RikQ9CUJ8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
4930519P11RikQ9CUJ8 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms