Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhobtb3Q9CTN4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhobtb3Q9CTN4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms